# 生信人应该这样学R语言 **Repository Path**: ybwrep/shengxin_skill_tree ## Basic Information - **Project Name**: 生信人应该这样学R语言 - **Description**: 生信人应该这样学R语言曾健明在GitHub的资料 - **Primary Language**: Unknown - **License**: Not specified - **Default Branch**: master - **Homepage**: None - **GVP Project**: No ## Statistics - **Stars**: 0 - **Forks**: 2 - **Created**: 2020-08-30 - **Last Updated**: 2020-12-20 ## Categories & Tags **Categories**: Uncategorized **Tags**: None ## README # 针对B站R语言视频的配套代码 本来呢，视频都免费送给大家学习了，我是不想再耗费时间去整理这些学习资料和代码了。 但是不少重量级嘉宾都表示督促其学生在学习我的视频，大佬的面子还是要给的，勉为其难把代码整理一下，并且系统性介绍一下B站R语言视频吧。 视频应该是都在：https://www.bilibili.com/video/av25643438/ 如果是需要安装R包，请务必参考：http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 代码 ### 第3期视频 目录如下： ``` 00.安装R包 01.基础变量 02.数据导入导出 03.画个热图-学习R包 04.ensembl2symbol 05.任意基因任意癌症表达量分组的生存分析 06.任意基因任意癌症表达量和临床性状关联 07.相关性分析 08.芯片表达矩阵下游分析 09.RNA-seq差异分析 10.超几何分布检验示例及原理 11.生信绘图大全 12.GSEA 13.shiny ``` 第3期视频配套练习题是,R语言小作业：http://www.bio-info-trainee.com/3750.html 练习题`代码`（答案）在： 【R语言小作业】 文件夹 ，下载我这个GitHub的project，然后直接进入文件夹，打开里面的文件 `tmp.Rproj` 就可以唤起你电脑的Rstudio软件，开始跟着我的视频完成作业啦！！！ 视频解答在：https://www.bilibili.com/video/av25643438/?p=13 大约有十万人观看了我的视频教程，下面是一些优秀学习笔记列表： - https://www.jianshu.com/p/8da5786658a7 该列表持续更新，欢迎大家踊跃发邮件(jmzeng1314@163.com)给我，展现你的学习过程，我会认识你的。 ### 第2期视频 再次强调，视频是免费的，并不是为了服务你，所以这些视频讲解的知识点会有部分重合，但是我每次录制视频教程，都是我的思考方式，我的知识点组织形式的展现，都值得初学者学习，所以请务必仔细听！ 目录如下： ``` R-1-学习资源介绍.mp4 R-2-与excel的区别.mp4 R-3-简单统计及数学函数.mp4 R-4-基础语法.mp4 R-5-高级数据处理技巧.mp4 R-6-绘图该如何学.mp4 R-7-作业.mp4 R-总结.mp4 ``` 课程配套讲义在：文档链接：https://mubu.com/doc/HGT7XBmgg 密码：muwu 大概问的最多的问题，就是在R-2-与excel的区别视频里面，我演示的文件来自于哪里，其实呢，你仔细看视频，然后如果学会我一直想传达的搜索能力，你就应该明白是可以**自己搜索**找到的 来自于文献：[Identifying and Targeting Sporadic Oncogenic Genetic Aberrations in Mouse Models of Triple Negative Breast Cancer - BioProject](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA398328/) 的数据： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA398328 点击 RunSelector. [Send results to Run selector](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?WebEnv=NCID_1_17670294_130.14.22.33_5555_1551319669_332912458_0MetA0_S_HStore&query_key=6) 就可以下载那两个文件啦。 ### 第1期视频 虽然后面还有十几个视频，但主要是很久以前我的一些R碎片化知识点讲解，并不介意大家继续学习。 ### 关于速查表 GitHub里面还有速查表，自取，不谢。 ### 关于进阶 很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章，所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程： - 代码在：https://github.com/jmzeng1314/geo - 配套教学视频在B站：https://www.bilibili.com/video/av26731585/ - 还有一个公共数据库挖掘：https://www.bilibili.com/video/av37568990 ### 配套练习题 初级10 个题目，尽量根据参考代码理解及完成： 中级要求是：http://www.bio-info-trainee.com/3750.html 高级要求是完成20题：